在平王敦之乱时，郗鉴能发挥主要作用即在于他掌握了一支军队。他以流民帅的身份过江，由于门阀士族尚未坚定地站在朝廷一边，明帝只能筹之于门阀士族以外的士族人物郗鉴，桓彝，而他们则利用流民武装。郗鉴通过江统与东海王建立了些许联系，有一定的门户背景和社会地位，之后又借重于纪瞻，与王敦毫无瓜葛又能持重效忠，使得他能与明帝共谋，并利用流民帅灭王敦，以此功跻身于门阀政治之中，高平郗氏也逐步上身为第一流侨姓士族。

流民帅解决了朝政重大问题，收到了很大效果。但是朝廷对于流民武装的不信任，流民帅与东晋政权相互猜忌，唯一担心的就是被朝廷夺兵；朝廷更担心他们恃功反噬，极力内徵以使其脱离部众，结果导致苏峻、祖约之乱。据史，郗鉴也得内徵，但由于其战功，更重要的是朝廷中庾氏兴起，王导与之交结，郗鉴在陶、王及庾、王矛盾中起到平衡调节作用，而平衡能够实现的重要因素是他对京口的经营[7]，军事上拱卫京师，控制三吴。

于此，要提到东晋上、下游之争。由于南北分裂以及地理环境因素影响，江南上、下游形成相对独立的军事中心[8]。总的来说，上游荆州与下游徐兖之地相互对峙[9]；江州为上下游的平衡地。门阀势力在除了朝廷斗争外，还竞据方镇，以外制内通过在外握有兵权，对建康形成压力，继而，影响甚至控制建康时局。

门阀势力的强大将争斗由朝中扩散到地方，且方式逐渐转变为方镇竞争，在荆，江，豫，徐，雍，兖等州刺史任职上展开不断争夺。之前的“王与马共天下”，朝廷内外都为王氏所据，使得门阀局面失据，险于崩坏，后由于其他门阀压力特别是郗鉴的努力，才得以延续。苏峻乱后，庾亮引咎出镇豫州，开始豫、扬的相持，也开始了门阀方镇竞争的局面。结果，在经历江州之夺，王充之之死后，琅邪王氏已经衰落，只能依靠祖宗余荫，靠社会影响维持。庾氏大为发展，但是，庾氏起自外戚，根基不深，庾翼死后也衰落急骤。桓温因缘际会得镇荆、梁八州，又坐待司马昱、殷浩北伐失败，再借北伐，声望大增，步步紧逼中枢。这时王、谢的大族的政治斗争在关键时刻给桓温掣肘。皇位的一废一立[10]，同时几家士族全凭政治斗争制衡篡晋积谋已久的桓温且得以成功，体现了皇权的最低点，士族权力的最高点。

朝廷鉴于上游压力，开始了兵力的组建，即是那一代代的北府兵。郗鉴长期经营京口，为淝水之战时谢氏组建新的北府兵奠定了一定基础。王恭据京口，与荆州殷仲堪等联兵反对执政，刘牢之据京口镇压农民起义，刘裕借此平定桓玄之乱，最后竟然以京口方镇移晋祚。