刘谨并非无能之辈，也未曾将国事当作儿戏。史载，刘谨将奏章带回私第后，都与他的妹婿礼部司务孙聪及华亭人张文冕商量参决，再由大学士焦芳润色，内阁李东阳审核之后颁发。还是颇为慎重的。用事期间，他针对时弊，对政治制度作了不少改动，推行过一些新法。即所谓“刘谨变法”。据《明史》，“给事中屈铨、祭酒王云凤请编瑾行事，著为律令。”另据《明通鉴武宗》“‘辛丑，兵科给事中屈拴，请颁行刘谨所定《见行事例》，按六部为序，编集成书，颁布中外，以昭法守。诏‘下廷臣议行。’”不过，对于专权太监，正史从不可能有丝毫正面评价，所以其《见行事例》所拟的改革措施及成效如何，史料基本不载。不过据《明史列传192》，“廷臣奏瑾所变法，吏部二十四事，户部三十余事，兵部十八事，工部十三事，诏悉厘正如旧制。”如此看来，其措施大概涉及四部，包括人事、民事、军事方面共85项措施。

　　现在只能从一些相关的记载里面，粗略了解刘谨的一些改革措施，其中有建立内厂钳制东西厂的权力，“时东厂、西厂缉事人四出，道路惶惧。瑾复立内行厂。”此外，“瑾峻刑”，其执法很严，颇有朱元璋之风。对于打击官员失职和贪污腐败不遗余力，以独特的“罚米例”，对失职官吏以罚米为单位的俸禄为手段，“丁末，工科给事中吴仪核宁夏、固原等处仓场秋坯亏折之数，劫历任巡抚都仰史徐廷薄……等十六人，侍郎硕佐及管粮郎中、副使、金事徐键等十八人，又通判董全等一百八十八人，又以马价盐课劫巡抚宁夏全都御史刘宪、巡抚陕西右副都御史杨一清及苑马寺卿、全事、知府、间知及管屯卫宫十余人，皆入罚米例，重者五百石，轻者三百石以下，致仕者半之。”又，“辛丑，给事中白思诚、御史储珊等，复参辽东仓库自弘治十五年至正德三年前后各任椰移亏折之数，遂及都御史王宗彝……及郎中、给事中、御史等凡数十人。除病故者勿追，余俱各罚米输边，自一千石以下有差，其中所罚有至再至三者。”(《明通鉴 武宗》)

　　刘谨的改革措施还包括降赋税，减轻农民负担。“三月，甲辰，振浙江饥……又停止本年应解杂款银六万两以宽民力。”建立官员不定期考察制度，“己酉，诏吏部考察京宫不必以时。”为避免战事发生时各镇守将领拥兵自保或各自为战，边防方面，“乃请仿王越、秦等故事，仍设文职大臣总制三达，镇、巡以下皆受节制”，对于屯制，刘谨下令作重新的全面勘查，清理了一些假冒的不法之事，整顿盐法亦有成效，“秋，七月，戊戌，刘复矫旨造御史乔岱等往核两浙盐课，追论历次巡盐御史及运司官赔偿商课，自数千两至数百两，按历年深浅及大课多寡以定陪纳之数，皆令输京师内承运库。”(《明通鉴 武宗》)