由此看来，刺马案背后的主谋就浮出水面了，正是湘军的势力在背后起作用，然而到底是谁是主谋呢？史学界到了这个地方就不肯深究了，我看过一些资料，最具代表性的就是台湾史学家高阳先生的推论，他认为是江南水师提督黄翼升干的，这里有好几个疑点，以马新贻的两江总督的身份，黄翼升就算有两个胆子也不敢刺杀马新贻的，第二，马新贻被刺后，幕后主使者调用的力量绝非一个江南水师提督所能调动的，第三点，如果真是他干的，就一个水师提督，那么当时慈禧太后马上就可以把他绑到菜市口，何必如此瞻前顾后，裹足不前？

由此几点，可以看出，黄翼升绝非幕后主使，他不过是某些人手里的一个走卒而已。至于到底是谁主使得，笔者在这里大胆推断：幕后主使应该是湘军的大人物，即有可能是曾国藩！之所以这样说，是跟清廷处理这个案件的态度有关，在连审不利的情况下，清廷的口风不仅没有变硬，反而有松动的迹象。

4.清廷转变态度口气放松。

当时慈禧太后正有丧母之痛，身体也不很好，但仍力疾视朝。恭王怕吓着了两宫太后，不敢多说被裁湘军流落在两江的种种不法情事，只在严讯凶手优恤马新贻外，谈到两江总督悬缺，认为非曾国藩回任不可（从这一点看，恭亲王倒是知道幕后真相的）。

远在江宁的张之万一到任，马上想一下两全其美的好办法。办法是替张文祥想好的一套口供，一要显得确有深仇大恨，完全是张文祥个人处心积虑，必欲得而甘心，借以搪塞“严究主使”的朝命和清命；二要为马新贻洗刷清誉，而且要隐隐含着因为公事认真，致遭小人之怨的意思，这样，马新贻之死，才能有殉职的意味。

这套假口供是如此说法，张文祥本是李侍贤手下的裨将，洪杨平定，他逃到了浙江宁波，与海盗有所勾结，同时开了个小押当，隐姓埋名，苟且度日。等马新贻调了浙江巡抚，海盗为患，派兵剿治。在浙江象山、宁海有一处禁地，名叫南田，向来为海盗所盘踞，马新贻捉住了其中的头目邱财青，处以死刑，另外又杀了海盗五十余名，其中颇多张文祥的朋友，平日常受他们的接济，这一下等于断了张文祥的财路，因此他对马新贻恨之入骨。

这以后又有一连串的怨恨，张文祥开小押当，而马新贻因为押当重利盘剥小民，出告示查禁，张文祥生计顿绝，便起了报复的心。又说，张文祥的妻子罗氏，为人诱拐潜逃，让张文祥追了回来，但人虽未失，卷逃的衣物为奸夫带走了，一状告到巡抚那里，马新贻认为此是小事，不应烦渎大宪，状子不准。不久，罗氏复又潜逃，张文祥追着了，逼她自尽。至此人财两空，认为马新贻不替他追赃，以致他的妻子轻视他，于是立志报仇。