经过一段时间的政治思想教育后,对那些作用较大的起义部队,如湖南陈明仁、绥远董其武、新疆陶峙岳等部,及时给予番号,正式编入人民解放军序列,并按照人民解放军的编制,对部队的人员进行了适当的调整。其他部队也是如此。人民解放军在这些部队中建立政治工作制度,选派优秀政工干部到这些部队担任政治委员和政治教导员、指导员;建立各级党的组织,积极慎重地发展出身成分好,经教育思想觉悟提高快,对中国共产党的性质、任务,人民军队的宗旨有较深刻认识,在各方面都表现突出,又积极要求加入中国共产党和青年团的优秀积极分子加入党团组织,使整个部队置于中国共产党的绝对领导之下;执行人民解放军的三大纪律八项注意和各种条例、条令。如西北军区,1950年在第二十二兵团发展党员2728名、团员1395名,建立党支部182个,基本做到了“把支部建在连上”的要求。对其他起义、投诚和接受改编部队,则拆散原建制,分别补入人民解放军各部队。对于起义军官,则视不同情况,进行分别处理,对率部起义且有影响的高级将领,给以适当的安置;对在学术上有一定造诣的,安排到院校执教;对年龄较轻,罪恶不大且有文化、有技术的下级军官则留在部队;对留之无用、放之无害的,则进行复员或资遣回乡;对老弱残疾而又无家可归者,则教育留养;对罪大恶极的反革命分子和特务恶霸及其他坏分子,进行管训或依法处理。

由于各战略区严格执行中共中央制定的对起义、投诚和接受改编部队的政策,经过半年多的努力,成功地将177万国民党部队改造成为中国共产党领导下的人民军队。这些部队和人员,在后来的剿匪反霸、抗美援朝和社会主义经济建设中,都作出了贡献。