小说对武则天之描写适与敖曹形成对比。武则天先是怂恿唐高宗处死大臣禇遂良，贬斥长孙无忌，“僭乱朝权，出入无忌”，残酷地杀害王皇后和萧淑妃，在唐高宗死后，先后废掉继承皇位的太子李哲、次子李旦，大肆杀戮唐朝宗室，重用酷吏来俊臣、索元礼，实行严刑峻法，杀人无数。而又淫乱宫廷，先与卖药无赖冯小瑶交，又得张昌宗、张易之，其手诏召敖曹，称“思得贤士”，一见敖曹即“意动”，一经交合即叹相见恨晚，既改元如意，又表示愿意弃君臣之礼而称夫妻。她称赞引见之牛晋卿“贤于魏无知远矣，千金不足比也”。她阅读《春秋》看到晋献公宠爱骊姬而杀害太子时，认为其爱骊姬比起自己爱敖曹来尚浅。又效仿民间男女烧香疤盟誓，于阴部烧香疤志情。小说中的武则天淫荡而残暴，唯一可称者，为其对敖曹所生之感情，而所谓的情爱实亦产生于纯粹肉欲的满足。

小说写薛敖曹以性事满足武则天，以获得武则天的真情回报，希望借此助李唐复国，虽未最后达到目的，但是也为助唐保存血脉作出贡献。将性与政治、国事联系，不是将性交作为动物式的淫乱加以铺陈描写，这正是《如意君传》的深刻之处，也是其与明代后期的白话艳情小说的不同之处。薛敖曹与武则天之关系，在中国传统文化背景上也有独特的意义，一反男尊女卑的伦理，薛敖曹以男子之身而为女皇帝的男宠，竭尽力量迎合女皇，在忧虑和痛苦中战战兢兢，最后终于舍弃了富贵，毅然逃离宫廷，流落民间，皈依道家，无欲而安，是对传统文化中阴阳关系的反面解读，以男人在女权统治中的逃亡，对男权下的女性地位作了无字真解。

至于小说之性质，明代学者认为是一部借男女性爱揭示历史真相的小说，而自清代禁毁小说，将其列为淫秽小说，一直到现代学者，仍称其为淫秽。就小说本身看来，其中一半以上篇幅是对性交的细致描写，称其为性爱小说应不为过。但是小说描写性爱的态度和语调的客观冷静，又与明代后期的艳情小说有所区别。小说前华阳散人《如意君传序》评论小说对武则天宫廷丑闻的描写，“虽则言之丑也，亦足以鉴乎？”而其鉴戒既表现在对武则天残害忠良、任用酷吏、暴虐荒淫之描写，亦表现在对唐王室淫乱之嘲讽，黄训《读如意君传》即感叹：“唐之昏风甚哉！”先有唐太宗淫弟妻，继有唐高宗淫父妃，又有唐玄宗淫子妃，而宫廷内部之淫乱更不可胜言，“兄不兄，子不子，父不父，可以为人乎？况可以为君乎？”《如意君传》选取武则天的独特意义在于，太宗、高宗、玄宗之乱伦，皆为男子主动，而武则天则以女子淫男子，武则天之淫弄男子所恃者为权势，而其权势得自高宗之所授，高宗之所以授权柄于则天，是为其色所迷，而其之所以敢迷于父妃之色，因有其父太宗淫巢王妃为榜样，“弟死不难于烝其妻，父死岂难于烝其妾？” 柳伯生跋认为小说发历史之所蕴，如经文之注解，《如意君传》“叙事委悉，错言奇叙，比诸诸传，快活相倍”。