温泉依温度之高低不同可分为三类，高于75℃者为高温温泉，介于40℃至75℃者为中温温泉(台湾温泉大多属此类)，低于40℃者为低温温泉。而按热水的酸碱性不同还可分为三类，酸碱值低于6者为酸性温泉，例如大屯火山群及龟山岛所分布的温泉；氢离子浓度大于8者为碱性温泉；酸碱值在6与8之间者为中性温泉，本省温泉极大多数即属中性温泉。这数种分类法都只是概括性地分别台湾温泉的种类，以下我们就从三方面来谈台湾温泉的种类。
依化学成分分类
温泉水中常见的阴离子为氯离子、碳酸氢离子及硫酸根离子，根据其相对含量可将台湾温泉分为三类，即以氯离子为主的氯化物泉，以碳酸根离子为主的碳酸氢盐泉，以及以硫酸根离子为主的硫酸盐泉。事实上，温泉水中所含阴离子常不止一种，假如有二种主要阴离子等量存在，则成合型温泉，如硫酸盐氯化物泉与氯化物碳酸盐泉等皆是。大屯火山群温泉依其化学成份可分为三种，第一种为酸性硫酸盐氯化物泉，是由地底深部酸性硫酸盐氯化物热水参杂少量地表水而成，当热水接近地表时，水中部分硫化氢氧化成硫酸，提高了热水中硫酸根离子及氯离子的比率。第二种为低浓度酸性硫酸盐泉，主要由蒸汽冷凝而成，因蒸汽中所含氯离子很少。第三种为低温低浓度中性碳酸氢钙泉，可能为地下水间接加热而成，较为少见。变质岩区温泉以碳酸氢钠泉为主，酸碱值在6与10之间，所含氯离子很少，与火山区及沉积岩区温泉之氯离子含量差别很大，主要是因为变质岩区较火山区和沉积岩区缺乏氯化物来源的供应。沉积岩区温泉计有氯化物碳酸氢盐泉、碳酸氢钠泉与氯化钠泉三种。前二种所占比例较大，可能是因为地底深处变质岩内热水上升，进入沉积岩层与氯化物水混合而成，礁溪及员山温泉即属此例。
依地质分类
变质岩区为构成台湾岛弧之核心部分，位于第三纪造山运动与火山地震带上，岩石比较破碎，地质构造也较复杂，但却是提供地下深水循环之有利条件。同时因位于火山地震带，火山活动及侵入岩体可能是形成温泉之主要热源之一。台湾温泉大多分布在此岩区内，计有六十六处温泉，约占全省温泉的四分之三。变质岩区温泉主要为中性至弱碱性，无腐蚀性，较适合开发利用。新第三纪沉积岩层温泉的分布较为零星，总共有十二处，大多位在主要构造线附近，其中并有一处较重要的温泉群集在触口断层附近，包括中仑、关子岭及六重溪等温泉。此岩区温泉亦呈中性至弱碱性，无腐蚀性，适合开发利用。
