中美合作所全称中美特种技术合作所，是由国民党军事调查统计局（也就是俗称的军统）与美国海军情报署联合组建的一个情报机构。
之所以组建这个机构，合作的双方都有自己的目的。众所周知，1941年12月8日，日军偷袭珍珠港，致使美国太平洋舰队几乎全军覆没。美国方面想通过合作获得军统在破译日军密码方面的经验，以及通过军统遍布全国的庞大情报网，为其收集中国沿海地区及太平洋地区的日军调动情况和这些地区的气象、水文等资料。而军统方面则希望通过合作得到美国先进的通讯器材、交通工具、军火，以及一些所谓的特种技术的先进经验。双方一拍即合，于1943年4月15日成立了该所，主任由戴笠亲自担任，副主任为美国海军中校梅乐斯。它的主要任务是（１）扩大搜集与交换情报，分呈两国最高统帅部参考；（２）严密布置东南沿海的敌后情报网，准备策应美军登陆；（３）布置中国全国气象网，制定气象预报，提供美国海、空军参考；（４）侦译敌方电讯、研究敌人动态；（５）加强情报通讯、争取情报的时效，使能制敌机先；（６）扩大警特训练，以达成防奸防谍，维护治安的任务；（７）开展心理作战；（８）加强秘密破坏工作，摧毁敌人的军事设施及军用物资。
根据这些要求，中美合作所的美蒋特务很快在全国各地建起了１６５座气象站、通讯电台，并由美国特工人员先后开办了２２个特工训练班，为军统训练和装备了１０万多名特务，并为其提供了９０００多吨弹药器材和其他军用物资，组成了一支特殊的武装特务部队。
在对日进行的特种作战方面，中美合作所做了很多的工作，也有很大的成绩。美国空军击落日本海军大将山本五十六的座机，就有中美合作所的军统局人员在电讯侦测和密码破译方面的功劳。同时，中美合作所还建立起了若干为美国海、空军提供气象情报的气象工作站、观测哨等，这些气象情报在美军对太平洋上日占岛屿展开逐岛进攻和轰炸日本本土的军事行动中，都起了重要作用。战后美国海军部的一份报告甚至有这样的评价：中国方面通过中美合作所向美国提供的日本占领区军事及气象情报，“成为美国太平洋舰队和在中国沿海的美潜艇攻击敌海军的唯一情报来源”。除去军事行动外，中美合作所还进行了一些对日心理战、经济战方面的工作。如收听日伪电台广播并用秘密广播进行干扰和反宣传，展开宣传攻势瓦解日军士气，在日伪军中制造恐慌情绪，鼓舞敌后抗日军民斗志；印制汪伪储蓄券假钞偷运到沦陷区，扰乱日伪金融，并大量收购日货与沦陷区物资运回大后方……
