与球员生涯相比，李秋平的教练生涯更为辉煌：1990年－1992年，李秋平担任上海队女篮主教练；1993年－1994年，担任上海青年队男篮主教练；1994年，从中国篮球职业联赛开始以来一直担任上海男篮的主教练，是CBA联赛中担任一支球队主教练历史最长的一个； 1996-1997赛季，带队获得CBA联赛第六名；1997-1998赛季，上海东方大鲨鱼俱乐部获得CBA联赛第五名，李秋平获“全国最佳教练”称号；1998-1999赛季，上海东方大鲨鱼俱乐部获CBA联赛第六名。