届城运会加大了反兴奋剂的力度，规定若代表团发生1例兴奋剂事件，则取消该代表团参加本届城运会道德风尚奖的评选资格；若出现2例，则取消该代表团的参赛资格和所有成绩，并通报代表团所属地政府，情节严重的还将取消所在省代表团参加第十一届全国运动会道德风尚奖评选的资格。在决赛阶段比赛赛场也悬挂了大量反兴奋剂宣传画，发放教练员宣传手册，并通过发放反兴奋剂宣传手机链等青少年喜闻乐见的形式对参赛运动员进行教育。10月24日至11月2日期间，还将举办“历史与未来——奥林匹克反兴奋剂四十年”武汉站主题展览，届时参赛各队运动员、教练员都将分批到现场进行参观学习，提高自觉抵制兴奋剂的意识和能力。

　　此外，城运会执委会还在开幕前联合其他部门，开展了对武汉地区兴奋剂药源的防治性清理和市场整顿。针对参赛队员年龄低、队伍构成复杂、对反兴奋剂意识和知识不足的特点，城运会特别向每个运动队发放了一份禁药清单，上面有国际奥委会列出的禁药，要求各参赛队按照清单进行自查，避免误服的情况发生。