第47圈，安全车回去，比赛重新开始。马萨已经顺势升至第3，莱科宁进入第7，法拉利和迈凯轮的结局还未可知。马萨尝试在直道上加速想要超越科瓦莱宁，不过不擅雨战的马萨实在有些勉为其难。反倒是莱科宁这边，已经顺势升至第5。但是，莱科宁的圈速相比迈凯轮仍然有些差距，甚至没能追近库特哈德。第55圈，拉尔夫－舒马赫回到维修区，在富士又一位主场车手黯然离场。

　　同一圈，莱科宁终于追到库特哈德。第57圈，在意想不到的5号弯，基米从外线强行超越库特哈德。无论是库特哈德本人还是法拉利维修区内的工作人员似乎都毫无准备。芬兰冰人完成了来到法拉利之后最伟大的一次超越。下一圈在同样的地方，莱科宁想要再玩一把外线，不过这一次却滑上了缓冲区。好在没有损失太多。第58圈，法拉利召回马萨进站，莱科宁顺势升至第3，开始紧追前面的科瓦莱宁。第61圈，莱科宁再次滑出赛道，这次犯错让他损失了3秒，落后汉密尔顿达到15秒。

　　第65圈，莱科宁尝试在弯角超越科瓦莱宁，不过两次连续尝试都未果。最后一圈，汉密尔顿以完美的状态冲线。历时2小时0分34秒579，汉密尔顿从杆位起步完美冲线，夺得日本大奖赛的冠军。科瓦莱宁落后8.3秒冲线，历史性地以第二登上领奖台。莱科宁郁闷地屈居第3。库特哈德、费斯切拉、马萨、库比卡和里尤兹分居4至8位。马萨在最后一个弯角，强行超越库比卡，从缓冲区驶回赛道冲线，压制库比卡夺得第6。

　　本站过后，汉密尔顿基本上已经触到了车手总冠军的奖杯。阿隆索和莱科宁的威胁只存在理论的可能。能够在进入F1的第一年就获得F1总冠军无疑是巨大的荣誉，无论在这背后间谍门还有队友之间的争斗带来了多少的不和谐。一周之后的上海，如果迈凯轮继续强势，那么就可以在中国站提前为汉密尔顿锁定车手总冠军。10月7日，2007赛季最后的谜底即将在上海揭晓。