疾病是基因表达发生改变的表现。参与这次试验的戒烟者都曾是嗜烟如命的人，他们以前平均每天的抽烟量在一包以上，都有慢性支气管炎或者肺气肿的迹象。不过，查理还发现，基因表达方式，与肺部疾病的严重程度并无太大关系，因而可能还有其他因素影响疾病的发展。

另一位科学家，波士顿大学的阿弗拉姆·斯比拉教授的研究结果也证明，吸烟确实会导致遗传改变。斯比拉说，他在研究中的确发现了吸烟者的基因表达方式发生改变。斯比拉在评价查理的研究工作时。说道：“呼吸道细胞似乎是在分子水平上发生了改变，而这种改变会持续很多年。查理的工作是一个良好的开端。但是，就目前来看，还不能说基因表达方式的改变与肺部疾病之间存在着必然的因果关系。”为了解决这个问题，斯比拉准备开展下一步研究工作：追踪同一批吸烟者在戒烟前后的身体状况，然后分析基因表达与疾病出现频率之间的关系。