富士S3Pro的外观比F80要大一些，具体尺寸为148×135×80毫米，在没有安装电池和镜头的情况下重量大约为835克。富士S3Pro采用了第四代SuperCCD SR II传感器，共有630万个感光点，其中617万个是有效感光点。因为SuperCCD SR II传感器的特点，每个感光点包含两个感光二级管，所以其中S像素有617万个感光二级管、R像素也有617万个感光二级管，因此富士S3Pro总输出像素可以达到大约1230万像素。这和一块全画幅的CCD或者COMS拥有的像素基本相当，因此富士S3Pro最大输出分辨率可以达到4256×2848，其他分辨率还有3024×2016（大约600万像素）、2304×1536（大约400万像素）以及1440×960（大约200万像素）可供选择。如果是拍摄JPEG格式的照片，每个分辨率还有（Fine精细/Normal正常/Basic基本）三种压缩比例可供选择，这样存储文件的大小和精度就有12种可供用户选择。