2004年季后赛赛，弗朗西斯与姚明联手从当是的湖人F4的牙缝里艰难抢到一场胜利，草草结束了两人联手的第一次季后赛。弗朗西斯与姚明第一次合作征战季后赛，彼此都看到了希望，两人相拥相约来年要走得更远。遗憾的是，短短几日就改变了弗朗西斯的命运，从此与他的大个子好哥们天隔一方。

2004年6月30日，与姚明合作两年后，弗朗西斯被道森抛弃，火箭和魔术正式达成协议，经过多达7人的球员交易，得分王麦迪与“特权”弗朗西斯互换东家。当年那个明目张胆地决绝到鱼腩打球的NBA第一人，在第一时间得知这消息后，再次拒绝到不喜欢的球队打球，不愿意到重起炉灶的魔术去耗费职业生涯。在火箭效力五个赛季，休斯顿当仁不让的老大被赶走。弗朗西斯的痛苦不只是离开了与他关系非常不错的姚明，更难受的是，在他打出了最出色最收敛的一个赛季后，却被道森交易走。

弗朗西斯在提起姚明的时候总喜欢说“我那哥儿们”，他在联盟里就是这样一个重情重义的男人，为了姚明，他甚至可以和太阳队的“小霸王”斯塔德迈尔动粗，可以在在更衣室顶撞火箭当年的代理教练史密斯。2004年3月16日，火箭主场出战太阳，当战斗进行到第三节比赛时，斯塔德迈尔带球晃过卡托在姚明头顶重扣，得意忘形的小霸王冲着篮板后的观众席一声狂哮。

弗朗西斯绝不允许斯塔德迈尔“欺负”姚明，还在火箭球迷面前嚣张。发怒的弗朗西斯在斯塔德迈尔转身时，上前伸出小臂顶到他喉咙上，斯塔德迈尔也捏紧拳头靠近弗老大。弗朗西斯当然不后退，立即又推了斯塔德迈尔一把。裁判和双方球员将两人拉开后，才平息了剑拔弩张的局面，弗朗西斯从此就成了火箭球迷心目中的老大。

范甘迪与弗朗西斯无法合作，在场上喜欢自由发挥的弗朗西斯根本受不了范甘迪防守至上的战术，不过一直处于暗战状态。2004年超级碗“逃课”的弗朗西斯激怒了范甘迪，被禁赛一场，将两人的矛盾激化。“超级碗”就像一根导火线，引爆了埋在范甘迪与弗朗西斯之间的炸弹。范甘迪与弗朗西斯互不让步，为了树立起范甘迪的权威，加上弗朗西斯的球风与火箭的战术确实不合拍，当年夏天，弗朗西斯就成了火箭引渡麦迪的牺牲品。

2004年6月30日，弗朗西斯从休斯顿东迁奥兰多。“NBA就是生意场，我理解这点，”当时弗朗西斯接受采访时脸上毫无表情。当他看到火箭与国王的“中国赛”后， 他第一次痛心了：“本来应该是我到那里（中国）的，我想和姚到他的国家。”他的确很有着强烈的愿望，希望和姚明在休斯顿为总冠军而打拼，这也是他现在选择回火箭的根本原因。

2005年1月21日，姚明率火箭造访奥兰多。赛前弗朗西斯解释说，这场比赛只是一场普普通通的比赛。不过对多情而桀骜不驯的弗朗西斯而言，这场比赛的意义注定不一样，他嘴再硬也改变不了这个事实。当时，他与火箭与往日战友加兄弟的姚明首次狭路相逢，勾起了伤心往事。