据专家介绍，由于“南海Ⅱ号”发现现场水流湍急，暗礁密布，海域情况比较复杂，历来是沉船多发地，在当地俗称为“三点金”。专家分析，也许正由于附近多暗礁，许多船只过而不停，才保证了“南海Ⅱ号”沉睡海底数百年而不被惊扰。有专家初步认为，“南海Ⅱ号”的沉没很可能就与触礁有关。

　　对比“南海Ⅰ号”，“南海Ⅱ号”的价值如何？魏峻说，“南海Ⅱ号”与“南海Ⅰ号”各有各的研究价值，一条在粤东、一条在粤西；一条是明代、一条是宋代，两条船的意义都很大，都是海上丝绸之路的重要物证，会使海上丝绸之路的研究更加丰富